Struktura plików ispCP:

<cli> / # Makefile dla wszystkich systemów operacyjnych configs/ # Pliki konfiguracyjne contrib/ # 3rd Party Tools database/ # Pliki bazy danych do instalacji docs/ # Lista Paczek i INSTALATOR (dla wszystkich Systemów Operacyjnych) engine/ # Silnik Perl'a ispCP gui/ # Interfejs WWW (GUI)

  admin/               # Pliki PHP Admina
  client/              # Pliki PHP Kilenta
  domain_default_page/ # Domyślna strona domen (widoczna po utworzeniu domeny)
  errordocs/           # Strony błędów
  include/             # Pliki inkludowane (Funkcje ...)
  orderpanel/          # Panel zamówień ispCP
  phptmp/              # tymczasowe pliki PHP
  reseller/            # Pliki PHP resellera
  themes/              # Style (Templatki)
  tools/               # ispCP Tools (PMA, Webmail, Filemanager)

keys/ # Klucze do szyfrowania/deszyfrowania language-files # Pliki języków tools/ # Demon ispCP i narzędzia dla deweloperów

  deamon/              # Demon ispCP
  translations/        # Narzędzia do tworzenia tłumaczeń

</cli>